Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lig3P97386 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lig3P97386 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms