Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl21cP86793 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccl21cP86793 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccl21cP86793 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl21cP86793 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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