Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nucb2P81117 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nucb2P81117 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms