Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms