Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Irx2P81066 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Irx2P81066 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms