Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp7P70280 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms