Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn1P70268 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms