Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbdsP70122 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SbdsP70122 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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