Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc5P62196 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms