Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcbp1P60335 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcbp1P60335 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms