Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tpm2P58774 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms