Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samsn1P57725 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samsn1P57725 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms