Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CckbrP56481 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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