Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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