Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Map3k1P53349 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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Map3k1P53349 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Map3k1P53349 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms