Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb41l4aP52963 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms