Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClgnP52194 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ClgnP52194 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ClgnP52194 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ClgnP52194 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms