Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Defa6P50704 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms