Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TspoP50637 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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TspoP50637 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TspoP50637 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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TspoP50637 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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TspoP50637 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TspoP50637 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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