Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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PtpreP49446 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PtpreP49446 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PtpreP49446 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PtpreP49446 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtpreP49446 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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