Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3P48787 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms