Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl5P47962 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl5P47962 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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