Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf1P39428 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms