Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptpn11P35235 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms