Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms