Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pola2P33611 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pola2P33611 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pola2P33611 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pola2P33611 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms