Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh15P33146 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms