Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Saa4P31532 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms