Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc10P31257 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc10P31257 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms