Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou2f1P25425 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms