Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms