Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pde6bP23440 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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