Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk1P22518 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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