Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P20040 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P20040 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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P20040 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P20040 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms