Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms