Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl13aP19253 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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