Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms