Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18533 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18533 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18533 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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