Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18528 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18528 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18528 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms