Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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