Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp53P15975 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms