Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaraP11416 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaraP11416 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaraP11416 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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