Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Amd1P0DMN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms