Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf1P09925 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf1P09925 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms