Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LtaP09225 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LtaP09225 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LtaP09225 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LtaP09225 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LtaP09225 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LtaP09225 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LtaP09225 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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