Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxa5P09021 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms