Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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TtrP07309 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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TtrP07309 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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TtrP07309 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TtrP07309 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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TtrP07309 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TtrP07309 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TtrP07309 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TtrP07309 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TtrP07309 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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