Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01755 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P01755 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms