Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ifnb1P01575 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ifnb1P01575 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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