Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ccl20O89093 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccl20O89093 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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